جامعة الأمير سلطان تأسست في عام 1999 تحت اسم كلية الأمير سلطان الخاصة، وفي عام 2003م قامت وزارة التعليم العالي (وزارة التعليم حاليًا) بإعلانها جامعة حيث تفضل صاحب السمو الملكي الأمير سلطان بن عبد العزيز آل سعود بافتتاح هذه الجامعة. وقد شُيدت هذه الجامعة من قبل مؤسسة الرياض الخيرية للعلوم ومُنحت الترخيص من وزارة التعليم العالي كمؤسسة أكاديمية أهلية غير ربحية في مدينة الرياض. وتعدّ جامعة الأمير سلطان أول جامعة أهلية في المملكة العربية السعودية.

افتتح الجامعة صاحب السمو الملكي الأمير سلطان بن عبدالعزيز آل سعود، ولي العهد ونائب رئيس مجلس الوزراء ووزير الدفاع والطيران والمفتش العام في ذلك الوقت (رحمه الله). وقد شُيِّدت هذه الجامعة من قِبل مؤسسة الرياض الخيرية للعلوم، ومُنحت الترخيص من وزارة التعليم العالي بوصفها مؤسسة أكاديمية أهلية غير ربحية في مدينة الرياض.